Virgílio do Carmo da Silva nació el 27 de noviembre de 1967 en la ciudad de Venilale, en la parte oriental de la colonia de Timor Portugués, hoy República Democrática de Timor Oriental.
Cursó sus estudios primarios y secundarios en el Colegio de Dom Bosco de Fatumaca, donde obtuvo el diploma, y sintiendo madurar su vocación al sacerdocio, ingresó poco después en la Sociedad Salesiana. Hizo el noviciado en Fatumaca, en su país natal, y emitió allí sus primeros votos el 31 de mayo de 1990. Después fue enviado a Manila, en Filipinas, para estudiar filosofía y teología, hasta su profesión perpetua, hecha en Parañaque el 19 de marzo de 1997.
Al término de su formación, fue ordenado sacerdote el 8 de diciembre de 1998. Poco después, se le confió su primer destino como maestro de novicios en Timor Oriental, función que desempeñó durante cinco años hasta 2004, cuando fue nombrado ecónomo de la casa de formación y vicario parroquial en su Venilale natal.
En 2005 se trasladó a Roma, Italia, para un período de estudios de dos años en la Universidad Pontificia Salesiana, al final del cual obtuvo la Licenciatura en Espiritualidad. De vuelta a casa, se convirtió en Maestro de Novicios en 2007 y Director de la Casa Salesiana y de la Escuela Secundaria Técnica Don Bosco en Fatumaca, desde 2009, ocupando ambos cargos hasta 2014.
Para los Salesianos de Timor Oriental, fue Delegado de la Asociación de María Auxiliadora (ADMA), de 2007 a 2015, y de Formación (2013-16). En 2015, fue nombrado Superior de la Visitaduría Salesiana de Timor Oriental (TLS), ocupando el cargo hasta su promoción al episcopado el 30 de enero de 2016, cuando el Papa Francisco lo nombró, cuarto Obispo de Dili.
Recibió la consagración episcopal el 19 de marzo siguiente, en el área protegida de Tasitolu, mediante la imposición de manos de Joseph Salvador Marino, arzobispo titular de Natchitoches y nuncio apostólico en Timor Oriental, y tomó posesión de la diócesis durante una ceremonia posterior celebrada en la catedral de la Inmaculada Concepción de Dili. Eligió Ad Deum Patrem Omnipotentem (A Dios Padre Todopoderoso) como lema episcopal.
En su ministerio pastoral, se ha comprometido, entre otras cosas, a fomentar la reactivación del turismo religioso, para dar un nuevo impulso a la frágil economía del país.
El 11 de septiembre de 2019, el papa Francisco erigió la provincia eclesiástica de Timor Oriental, elevando la diócesis de Dili a sede metropolitana; al mismo tiempo, por tanto, monseñor do Carmo da Silva se convirtió en su primer arzobispo metropolitano.
El 29 de mayo de 2022, al final del Regina Caeli, el Papa Francisco anunció su creación como cardenal, que tuvo lugar en el consistorio siguiente, el 27 de agosto.
Actualmente, es miembro del Dicasterio para los Institutos de Vida Consagrada y las Sociedades de Vida Apostólica.
