Virgílio do Carmo da Silva nasceu em 27 de novembro de 1967, na cidade de Venilale, no leste da colônia do Timor português – hoje República Democrática de Timor-Leste.
Perfez os estudos primários e secundários no Colégio Dom Bosco, de Fatumaca, onde se formou e, sentindo-se chamado ao sacerdócio, pouco depois ingressou na Sociedade de São Francisco de Sales (Salesianos). Fez o noviciado em Fatumaca, seu país natal, e ali emitiu os primeiros votos no dia 31 de maio de 1990. Foi enviado a Manila, nas Filipinas, para estudar Filosofia e Teologia, até a Profissão perpétua, em Parañaque, em 19 de março de 1997.
No dia 8 de dezembro de 1998, no final da sua formação, recebeu a ordenação sacerdotal. Imediatamente foi-lhe confiada a primeira missão como Mestre de Noviços, em Timor-Leste, função que desempenhou durante cinco anos, até que, em 2004 foi nomeado Ecônomo da Casa de formação e vigário paroquial em Venilale, sua terra natal.
Em 2005 mudou-se para Roma, Itália, para um período de estudos de dois anos na Universidade Pontifícia Salesiana, ao final dos quais obteve a licença em Espiritualidade. Ao retornar à sua terra natal, tornou-se Mestre de Noviços em 2007; e, em 2009, Diretor da Casa Salesiana e da Escola Técnica Superior Dom Bosco de Fatumaca, exercendo ambos os cargos até 2014.
Foi Delegado para a Associação de Maria Auxiliadora (ADMA) para os Salesianos de Timor-Leste (2007-2015) e para a Formação (2013-16). Em 2015, foi nomeado Superior da Visitadoria Salesiana de Timor Leste (TLS), desempenhando a função até a sua promoção ao episcopado em 30 de janeiro de 2016 quando o Papa Francisco o nomeou quarto Bispo de Díli.
Ordenado Epíscopo em 19 de março, na área protegida de Tasitolu, por Dom Joseph Salvador Marino, Arcebispo Titular de Natchitoches e Núncio Apostólico em Timor-Leste, tomou posse da Diocese em cerimônia feita na Catedral da Imaculada Conceição, em Díli. Como lema episcopal escolheu ‘Ad Deum Patrem Omnipotentem’ (A Deus Pai Todo-Poderoso).
Em seu ministério pastoral empenhou-se, entre outras coisas, por favorecer o relançamento do turismo religioso, para dar um novo impulso à frágil economia do país.
Em 11 de setembro de 2019, o Papa Francisco erigiu a Província Eclesiástica de Timor-Leste e elevou a Diocese de Díli a Arquidiocese, sendo Dom do Carmo da Silva o seu primeiro Arcebispo Metropolitano.
No dia 29 de maio de 2022, no final do ‘Regina Caeli’, o Papa Francisco anunciou sua elevação a cardeal, que ocorreu no Consistório do dia 27 de agosto seguinte.
Atualmente é membro do Dicastério para os Institutos de Vida Consagrada e as Sociedades de Vida Apostólica.