Ks. Bihlmayer poświęcił swoje życie edukacji i prowadzeniu młodych ludzi oraz ochronie dzieła stworzenia. Tworząc w 2001 r. Fundację im. Księdza Bosko, pozostawił po sobie trwałą spuściznę, która nawet po jego śmierci będzie kontynuowana, wyrażając się w zaangażowaniu na rzecz lepszej przyszłości dzieci i młodzieży znajdujących się w trudnej sytuacji.
Salezjanin był również współzałożycielem “Aktionszentrum” w Benediktbeuern w 1969 r., które prowadził do czasu mianowania go rektorem klasztoru Benediktbeuern w 1985 roku. W latach 1973-1980 ks. Bihlmayer pracował również jako kapelan akademicki w “Catholic Foundation College” w Benediktbeuern. Na szczególną uwagę zasługuje jego zaangażowanie w powstanie “Zentrum für Umwelt und Kultur” (ZUK) przy klasztorze Benediktbeuern, ośrodka edukacji ekologicznej. W latach 1988-2011 pomagał w jego prowadzeniu.
W 1991 r. ks. Bihlmayer został mianowany przełożonym ówczesnej inspektorii Niemiec Południowych i przeprowadził wspólnotę zakonną przez trudny okres zmian, zawsze koncentrując się na potrzebach młodych ludzi. Nawet po dwunastoletniej kadencji jako przełożony inspektorii, ks. Herbert Bihlmayer pełnił liczne odpowiedzialne stanowiska we wspólnocie zakonnej i poza nią, począwszy od 2003 roku.
Zaangażowanie ks. Herberta Bihlmayera wywarło trwały wpływ na życie wielu ludzi. Jego głębokie zaufanie Bogu, humor i determinacja były przekonujące i motywujące.