Kothgasser était un modèle pour beaucoup dans son engagement en faveur de l'unité et de la communion. Ce n'est pas un hasard si « Faire la vérité dans la charité » était sa devise épiscopale, qu'il a toujours vécue avec une foi profonde et un engagement infatigable envers les personnes.
Alois Kothgasser est né le 29 mai 1937 à Sankt Stefan, dans le district de Feldbach, en Styrie. Il a fréquenté l'école primaire et secondaire dans sa paroisse d'origine puis, à l'âge de 18 ans, il a rejoint la Congrégation des Salésiens de Don Bosco, en prononçant ses premiers vœux le 16 août 1955 et ses vœux perpétuels exactement trois ans après. Après avoir obtenu son diplôme de l'institut « Don Bosco » d'Unterwaltersdorf, il a effectué un stage de trois ans en tant qu'éducateur à Unterwaltersdorf et Klagenfurt. Il a complété ses études de Philosophie et de Théologie à Turin, étant ordonné prêtre le 9 février 1964 dans la Basilique de Marie Auxiliatrice de Turin.
D'autres études ont suivi à Rome, à l'Université Pontificale Salésienne (PAS). Après avoir obtenu un Doctorat en Théologie, avec une thèse sur le développement du dogme dans la vision catholique, Kothgasser a ensuite travaillé au PAS comme Professeur associé de Dogmatique et Responsable de l'Institut de Spiritualité Salésienne. Le point central de ses nombreuses années d'activité académique fut Benediktbeuern, en Bavière, près de la frontière autrichienne, où il a enseigné la Dogmatique et a été Recteur du centre pendant plusieurs années (de 1982 à 1988 et de 1994 à 1997).
L'actuel Supérieur de la Province AUS, le P. Siegfried M. Kettner, ancien élève du regretté prélat salésien, rappelle aujourd'hui : « Le P. Kothgasser a formé d'innombrables jeunes prêtres - autrichiens et pas seulement - et a été pour nous un modèle non seulement par sa foi, mais surtout pour sa modestie. Déjà alors, quand j'étais étudiant, je me disais : « S'il y a quelqu'un qui a ce qu'il faut pour devenir évêque, c'est bien Kothgasser. » »
Nommé Évêque d'Innsbruck par le Pape Jean-Paul II en octobre 1997, il fut curé de ce diocèse pendant 5 ans, jusqu'en novembre 2002.
Le 23 novembre 2002, le chapitre des chanoines de la cathédrale de Salzbourg l'a choisi comme nouvel archevêque de Salzbourg. Le 27 du même mois, le Pape Jean-Paul II l’a nommé officiellement et il a pris possession de l'archidiocèse le 19 janvier suivant. En tant qu'archevêque, il détenait également les titres de Primat d'Allemagne et de legatus natus à Salzbourg.
Il considérait qu'il était important d'introduire l'esprit de Don Bosco dans son style pastoral. Il lui tenait particulièrement à cœur « d’atteindre les jeunes, en particulier ceux qui vivent de diverses manières dans la pauvreté, notamment dans la pauvreté relationnelle, » comme il l’a souligné dans une interview. C'est ainsi qu'il voulait donner vie à la spiritualité de Don Bosco.
Au sein de la Conférence Épiscopale Autrichienne, il était responsable de la liturgie, des séminaires, des facultés et collèges de théologie et des théologiens laïcs, et dans tous ces domaines, il s’est montré un évêque attentif à son peuple.
Devenu évêque émérite en 2013, il a passé près de neuf ans au Centre spirituel des Filles de Marie Auxiliatrice à Baumkirchen, où il a continué à travailler pour l'Église et à célébrer des fonctions religieuses, des baptêmes, des premières communions, des ordinations et bien plus encore, jusqu'à ce qu'en 2022, il s'est installé au séminaire de l'Archidiocèse de Salzbourg.
En apprenant son décès, l'évêque de Bolzano-Brixen, Mgr Ivo Muser, a déclaré : « Mgr Alois Kothgasser était pour moi un modèle épiscopal et un ami épiscopal. Il se caractérisait par sa manière équilibrée, paternelle et capable d'unir, par sa proximité avec les gens, par sa capacité d'écoute, par sa spiritualité salésienne et aussi par sa clarté théologique. »
