El P. João de Deus nació en Mirandela, Bragança, Portugal, el 15 de abril de 1928. En 1958 fue enviado a Timor Oriental, donde permaneció hasta su muerte. En 1963, fundó la Escuela Técnica Agrícola de Fatumaka y apoyó el desarrollo de las misiones católicas en Baucau.
En 1975, con el estallido de la guerra civil, el gobierno portugués ordenó la evacuación inmediata de todos los misioneros católicos de Timor Oriental, pero Don João de Deus decidió quedarse en el país, a pesar de los riesgos y peligros que corría.
En ese año fue capturado por los indonesios y liberado pocas semanas después.
Después del desmantelamiento de las bases en 1978, la Iglesia Católica fue la única institución que permaneció con la población durante la ocupación indonesia. Para apoyar la resistencia, los misioneros portugueses construyeron orfanatos en Baguia, Laga y Quelicai, que acogieron a huérfanos de guerra. Cuando Timor Oriental obtuvo su independencia, el P. João permaneció allí y continuó apoyando a la población local.
En 2012 recibió la Medalla de la Orden “Martinho Lopes”, una orden creada por el Estado para reconocer la contribución de la Iglesia Católica en la liberación nacional de Timor Oriental y para dar gracias por el apoyo y la cercanía a la población.
Francisco Guterres, Presidente de la República Democrática de Timor Oriental, quiso dar personalmente su último saludo al P. João de Deus, en la capilla de Don Bosco en Comoro.
El Presidente expresó, en nombre de todo el Estado, la máxima gratitud por la contribución que el P. João realizó en favor de la independencia nacional. El Presidente Guterres firmó un decreto presidencial, publicado ayer, 24 de septiembre, expresando una vez más su agradecimiento por lo que el P. João de Deus ha hecho en los años más difíciles para el país.
El Jefe de Estado de Timor Oriental transmitió a continuación sus condolencias a la Familia Salesiana por esta gran pérdida.