Nació el 15 de enero de 1875 en Viarigi, provincia de Asti. En 1856 Don Bosco había estado allí para predicar una misión. Y fue a Don Bosco a quien el padre encomendó a su hijo, llevándolo a Valdocco el 1 de octubre de 1887. El santo murió cuatro meses después, pero el conocimiento que Luigi tuvo sobre Don Bosco fue suficiente para marcarlo de por vida.
Así recordaba él mismo el hecho: “Estábamos en la temporada de invierno y una tarde estábamos jugando en el patio grande del Oratorio, cuando de repente escuchamos gritos de un lado a otro: '¡Don Bosco, Don Bosco!' Instintivamente todos nos precipitamos hacia el punto donde apareció nuestro buen Padre, a quien sacaron a pasear en el carruaje. Lo seguimos hasta el lugar donde debía subir al vehículo; Don Bosco se vio inmediatamente rodeado por la amada multitud de chicos. Estaba buscando frenéticamente la manera de ponerme en un lugar donde pudiera verlo a mi gusto, ya que deseaba ardientemente conocerlo. Me acerqué lo más que pude y cuando lo ayudaban a subir al carruaje, me dirigió una dulce mirada y sus ojos se posaron en mí. No sé lo que sentí en ese momento... ¡fue algo que no puedo expresar! Ese día fue uno de los más felices para mí; Estaba seguro de haber conocido a un Santo, y que ese Santo había leído algo en mi alma que sólo Dios y él podían saber".
Pidió hacerse salesiano: entró en el noviciado el 17 de agosto de 1891 y lo concluyó el 2 de octubre de 1892 con los votos perpetuos en manos del Beato Miguel Rúa, que le susurró al oído: "Variara, non variare" (Variara, no varíes). Estudió Filosofía en Valsalice donde conoció al Venerable don Andrea Beltrami. En 1894 pasó por allí Don Unia, el famoso misionero que recién había comenzado a trabajar entre los leprosos de Agua de Dios. "Cuál no fue mi asombro y mi alegría -cuenta el propio Don Variara- cuando, entre los 188 compañeros que tenían la misma aspiración, fijando su mirada en mí, dijo: 'Este es mío'".
Variara llegó a Agua de Dios el 6 de agosto de 1894. El hospital tenía 2.000 habitantes entre ellos 800 leprosos. Se sumergió totalmente en su misión. Dotado de habilidades musicales, organizó una banda que inmediatamente creó un ambiente festivo. El 24 de abril de 1898 fue ordenado sacerdote y pronto demostró ser un excelente director espiritual.
Entre sus penitentes también estaban miembros de la Asociación de las Hijas de María, un grupo de unas 200 chicas, muchas de las cuales eran leprosas. El joven sacerdote descubrió que no pocos de ellos se consagrarían voluntariamente al Señor. Pero esto se consideró una quimera porque ninguna Congregación aceptaba a un leproso o incluso a una hija de leprosos. Fue frente a esta observación que nació en él la primera idea de jóvenes consagradas, aunque fueran leprosas. La Congregación de las "Hijas de los Sagrados Corazones de Jesús y María" inició el 7 de mayo de 1905.
Se sentía cada vez más entusiasmado con su misión. Escribió: “Nunca me sentí tan feliz de ser salesiano como este año y bendigo al Señor por haberme enviado a este hospital, donde aprendí a no dejarme robar el cielo”. Habían pasado diez años desde que había llegado a Agua de Dios. Una década feliz llena de logros.
Pero ahora comenzaba un período de sufrimiento e incomprensión para el generoso misionero. Este período durará 18 años, es decir, hasta su muerte. Se vio obligado a alejarse de Agua de Dios; Mosquera, Contratación, Bogotá, Barranquilla... fueron los diversos lugares que le asignó la obediencia. En 1921 fue trasladado a Tàriba, localidad venezolana en la frontera con Colombia. Cuando llegó allí, su salud comenzó a deteriorarse de manera alarmante. El médico aconsejó, por razones climáticas, llevarlo a Cúcuta en Colombia. Fue allí, pero sus condiciones físicas se deterioraron en poco tiempo. Su cuerpo fue transportado a la capilla de sus Hijas en Agua de Dios.
Fue beatificado por San Juan Pablo II el 14 de abril de 2002.