Hace 50 años, el primer Obispo de la Prelatura Mons. Braulio Sánchez, SDB soñó con educar a los niños y jóvenes de la Región Mixepolitana, sueño que poco a poco se hizo realidad, gracias al apoyo de personas del lugar, quienes según sus posibilidades contribuyeron generosamente con material para construir una escuela. También contó con el apoyo incondicional de la Inspectoría salesiana, de salesianos misioneros y de muchas personas que, a pesar de no conocer el lugar, al oír hablar acerca de su objetivo de formar buenos cristianos y honrados ciudadanos, apoyaron económicamente a los misioneros salesianos, solventando la construcción del Colegio Salesiano de Matagallinas-Mixes, Oaxaca.
Actualmente el Instituto de Mejoramiento de Comunidades Indígenas (IMCI) funciona primero como escuela primaria abierta, para niños y niñas. En una segunda modalidad funciona como escuela secundaria bajo el sistema de internado.
Los Salesianos de Don Bosco (SDB) atienden a 45 varones y las Hijas de María Auxiliadora (HMA) asisten a 53 niñas, provenientes de las comunidades indígenas de la región.
Con gran alegría, la escuela salesiana está preparando la celebración del 50º Aniversario de su fundación, congratulándose por ser una casa educativa, formadora de excelentes ciudadanos, quienes actualmente ejercen sirviendo en cargos importantes dentro de las comunidades, personas comprometidas en ser honestas y empeñadas en el bien común, sirviendo ya sea como funcionarios públicos o colaborando dentro del contexto político; además del IMCI han surgido personas consagradas a Dios y al servicio del prójimo: sacerdotes y religiosas.
EL IMCI está dirigido por el P. Miguel Ángel Miranda; con él trabajan el P. Urbano Rodríguez Higareda, responsable de la economía, dos jóvenes salesianos religiosos y dos voluntarios salesianos.
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