Quando Luís nasceu, o pai tinha 42 anos e era casado pela segunda vez, com Lívia Bussa. Pedro era professor. Adorava música e canto, e animava funções paroquiais como organista e diretor do Coral que ele mesmo fundara na animada e estimada vila de Viarigi.
Luís nasceu durante um inverno rigoroso e, devido às circunstâncias, a parteira julgara prudente batizar o recém-nascido. Dois dias depois, completaram-se os ritos batismais.
Sua infância foi marcada pelas tradições locais e pela vida doméstica, combinação cultural-espiritual que muito contribuiu para moldar o caráter e transmitir conteúdos válidos para o crescimento do menino, marcando sua futura vocação missionária na Colômbia entre os leprosos de ‘Agua de Dios’ e na fundação das Filhas dos Sagrados Corações de Jesus e Maria.
O relacionamento de Luís com o Pai, seu formador e professor – que lhe transmitiu o sentido cristão da vida, os primeiros rudimentos da escola, o amor pela música e o canto – foi-lhe assaz importante.
Outro aspecto que influenciaria o crescimento do pequeno Luís era o fato de que a casa dos Variara estava quase sempre cheia de crianças. O pai Pedro, ao final das aulas, levava para a sua casa as crianças mais necessitadas da escola e, depois de dar uma aula de reforço, as confiava aos cuidados da Mãe Lívia. Assim faziam também as demais famílias. Luís cresceu nesse ambiente "oratoriano", onde sentia-se em casa, amado, e a presença do Pai e da mãe Lívia eram recursos educativos e afetivos de primeira ordem – não só para seus filhos mas também para as muitas outras crianças e jovens, especialmente as mais pobres e desfavorecidas.
Nos últimos anos, Luís conheceu um companheiro deficiente e dedicou-se a ele, cuidando para que se sentisse confortável. No fato, podemos ver uma semente daquela preocupação e proximidade que mais tarde marcaria a vida e a missão de Luís Variara a serviço dos doentes de lepra em Agua de Dios, na Colômbia.
Quando criança e jovem, experimentou Luís Variara o amor sincero dos pais e irmãos, e dos meninos da vizinhança: por meio do exemplo deles, conheceu a verdadeira face de Deus Pai – Fonte do amor autêntico.