Héctor Vargas Bastidas était né dans la ville chilienne de Valdivia le 29 décembre 1951. Fils de José et Maximiliana, il avait trois frères plus jeunes. Il a fréquenté les écoles de l'Institut Salésien de sa ville natale et il a ensuite entrepris le parcours de formation en tant que Salésien de Don Bosco.
Il a prononcé ses premiers vœux religieux le 2 juillet 1972, ses vœux perpétuels le 11 juin 1978 et il a été ordonné prêtre le 5 juillet 1980 par Mgr Tomás González, évêque émérite de Punta Arenas.
Il a passé sa vie salésienne dans les œuvres salésiennes de Puerto Porvenir, Punta Arenas, Talca, Santiago et La Cisterna. Il a été formateur et enseignant à Lo Cañas et Directeur des communautés de Linares et de l'Institut salésien d'Alameda. Il a également été Délégué provincial pour la Pastorale des Jeunes, Conseiller du Mouvement Salésien des Jeunes et animateur des mouvements de pastorale familiale.
Il a également été professeur dans des instituts d'État, diplômé de l'Université Catholique Pontificale du Chili, où il a étudié la Philosophie et la Théologie. Et il a également obtenu une maîtrise en Sciences de l'Éducation de l'Université Pontificale Salésienne de Rome.
Il a été conseiller pour les Pays du Cône Sud de la Confédération Interaméricaine de l'Enseignement Catholique (CIEC) et représentant du Bureau Mondial de l'Enseignement Catholique (OIEC) à la Commission Économique des Nations Unies pour l'Amérique Latine (ECLAC).
Pendant sept ans, il a été Président de la Fédération des Instituts d'Éducation Spéciale (FIDE) et il a également été membre du Conseil National pour la Certification de la Gestion Scolaire de la « Fundación Chile. »
Le Pape Jean-Paul II l'a nommé évêque de San Marcos de Arica, le 25 novembre 2003, et il a été ordonné évêque le 4 janvier 2004 suivant. Sa devise épiscopale était « Témoignage du Christ Berger. »
Il a publié plusieurs textes et deux Lettres Pastorales, l'une sur le Synode et le P. Hurtado et l'autre sur les Statuts des Paroisses, des Doyennés et des Assemblées Diocésaines mensuelles.
Il a été élu Président du Secteur Éducatif et Président du Secteur Ecclésial de la Conférence Épiscopale du Chili et Délégué du Chili à la Ve Conférence du Conseil Épiscopal d’Amérique Latine, qui a eu lieu à Aparecida, au Brésil.
Le 6 juin 2013, il a pris possession du diocèse de Temuco.
Source : Salésiens du Chili