En septembre 1965, l'Université déménage de Turin à Rome et l'année suivante, en octobre 1966, le Pape Paul VI préside l'Inauguration officielle du nouvel Athénée Pontifical Salésien.
Le 24 mai 1973, avec le Motu Proprio Magisterium vitae, l'Athénée est élevé au rang d'Université Pontificale, organisée autour de cinq Facultés : Théologie, Sciences de l'Éducation, Philosophie, Droit canonique et Lettres chrétiennes et classiques.
Le 31 janvier 1981, jour de l'anniversaire de la fête de St. Giovanni Bosco, Jean-Paul II visite l'Université.
Source : La Storia